Traitement eshel avec ISIS

[Olivier GARDE]

Je suis en train de prendre en main mon tout nouveau spectro eshel et je me heurte à une erreur lors du traitement avec ISIS.
J'en suis qu'au stade de cartographier ma CCD (une atik460EX) pour qu'ISIS puisse se repérer dans les longueurs d'ondes du Thorium.

Voici le message d'erreur que j'obtiens : "le nombre de colonnes est différent de 4". A priori il arrive bien à trouver les ordres, mais plus rien après avoir généré un fichier check.fit qui ne montre qu'une rangée verticale de carré qui semble correspondre aux différents ordres. (uniquement des carrés, pas les ordres)



De plus avec ISIS, j'ai un problème d'orientation du spectre verticalement entre un affichage avec MAxim DL et avec ISIS ou je suis obligé de faire un flip de l'image.

[Martin Dubs]

Hello Olivier,

Maxim is quite confusing, compared to ISIS or Audela. It displays images with Y increasing towards the bottom, just the opposite of ISIS which displays X and Y as a scientific coordinate system, X to the right and Y towards the top. For processing in ISIS Y has to decrease for the higher orders (low Y values, blue at bottom for ISIS). For the Shelyak echelle you can also check the distance between orders, this should increase with the higher orders, as you can see from the logfile (taken from the eshel at IAC80 at Teide, which kept me quite busy lately):
Ordre #30 - Position : 986
Ordre #31 - Position : 965 difference 30 - 31: 21
Ordre #32 - Position : 943
Ordre #33 - Position : 919
Ordre #34 - Position : 895
Ordre #35 - Position : 870
Ordre #36 - Position : 845
Ordre #37 - Position : 818
Ordre #38 - Position : 791
Ordre #39 - Position : 763
Ordre #40 - Position : 733 difference 39 - 40: 30
...
From what I can see in your log it looks like you have the wrong image orientation in ISIS (higher orders very closely spaced). Also check that you select the correct line (X and Y position, wavelength and order. I recommend to use Audela for checking the images, especially eshel View is very convenient (Audela is also recommended for recording). This eliminates the orientation problem and you see the images the same way as in ISIS and in FITSview and most other astronomic programs and you have more possibilities of scaling the image. I use Audela for recording spectra and guiding and ISIS for data reduction. A very good combination.

Regards, Martin

[Christian Buil]

Une recommendation. Au moins au début, pour la prise en main.
Essaye de travailler en binning 1x1 avec la 460EX. Les ordres sont mieux séparer (bon inter-ordre) et
la photométrie est supérieure.

Christian

[Olivier GARDE]

Martin, thank you for your answer.

Eventually, I'd like to be able to still use Maxim DL for acquisitions ...

I'll try other directions of the CCD.

[Olivier GARDE]

Bon, je suis en train d'essayer les acquisitions via le module eshel d'Audelà et là encore, je rencontre des problèmes de paramètrages pour la CCD (ici une ATIK 460 EX).

La fenètre de configuration du module eshel demande de renseigner les paramètres de la CCD



L'ATIK 460 EX a des pixels de 4,54u et une matrice de 2750x2200 pixels.

Dans ce panneau de configuration, que faut il rentrer comme paramètres dés lors que l'on utilise la CCD en binning 2x2 ?
La taille native du pixel (4,54u) ou sa taille en binning 2x2 (9,08u) ?
Même question pour la dimension de la matrice : 2750x2200 (1x1) ou 1374x1099 (2x2)
La doc ne précise que le cas en binning 1x1.

[Martin Dubs]

Hello Olivier,

it is some time ago that I used Audela for echelle spectra reduction. At that time (may 2011) there was an error in the eshel software. For recording spectra in binned mode you had to put the original pixel size, the binning factor and the original CCD size.
For analyzing spectra in eshel you then had to change the configuration to the binned pixel size, no binning and reduced image size because the analysis software did not contain the binning factor. I reported the error to Michel Pujol, who was taking care of the eshel software but I do not remember if the bug has been fixed. For my own purpose I modified the source code of Audela 20110109 but was not happy with the binned spectra, so I have not followed up on this.

If you want to use ISIS for processing then you can use: Audela - camera - windowed acquisition and do not have to worry about these problems. It also helps in choosing filenames conforming to ISIS. Just make sure that you use the same image size and position for all frames.

If you want to use Audela for eshel processing you may ask at the Audela forum:
http://fr.groups.yahoo.com/group/audeladev/
if this bug has been fixed. For quite some time in 2011 there was little support for the eshel module. Maybe Olivier Thizy knows more about the current version.

Of course you can also use Maxim for the acquisition and ISIS for spectra reduction, just make sure to get the orders in the right order as explained in my previous post.

I hope this answers your question at least in part.

Regards, Martin

[Christian Buil]

Oups dans mon message je voulais dire binnin 1x1 bien sur.

Il n'y a vraiment pas de raison que ISIS ne fonctionne pas (jamais sur
à 100% bien sur). Il faut bien sur insister
Surement un problème avec tes données. Il faudrait que
tu puisse poster à un endroit des images pour une vérification
(image ThorAr, LED, ...). Ca te parait possible ?

Christian

[Olivier GARDE]

Ok, merci Christian
Dés que j'ai un moment de libre, je poste des images du spectro sur un ftp.

[Olivier GARDE]

Bon, je progresse....
Je suis arrivé à utiliser Maxim DL pour les acquisitions et ISIS pour le traitement.
En fait, j'ai donc fait les réglages d'orientation de la CCD avec Audelà comme Martin me la suggéré et ensuite j'ai pris Maxim DL ou effectivement mon image est retourné de 180 degrés.

Après plusieurs essais sous ISIS, je suis arrivé à étalonner un spectre du Thorium en changeant les valeurs prédéfinis dans le fichier def_order.lst pour que ce soit compatible avec mon ATIK 460 EX en binning 2x2.

Voici le résultat, il me reste plus qu'à déterminer la réponse instrumentale.

Last news about my problems with Maxim DL and ISIS :
I got to use Maxim DL for acquisitions and ISIS for treatment.
In fact, I did the orientation of the CCD with audelà software as Martin suggested me and then I took Maxim DL or actually my image is rotated from 180 degrees.
After several tests with ISIS, I got to calibrate a spectrum of Thorium by changing the values ​​predefined in the def_order.lst file that is compatible with my ATIK 460 EX and 2x2 binning.

Here is the result, it remains for me to determine the instrumental response.